کسورات قراردادهای پیمانکاری شامل  ۵٪ سپرده حق بیمه و ۱۰٪ سپرده حسن انجام کار است. سپرده حق بیمه و سپرده حسن انجام کار پس از پایان کار و ارائه مفاصاحساب به پیمانکار عودت داده می‌شود. در ماده ۳۸ قانون تأمین اجتماعی ذکرشده کلیه کارفرمایان و پیمانکاران تحت عضویت سازمان تأمین اجتماعی را مکلف می‌سازد که علاوه بر بیمه کردن کارکنان خود، نسبت به بیمه نمودن نیروهای مربوط به پروژه‌های مناقصه‌ای و قراردادی نیز اقدام نمایند. درواقع کلیه پیمانکاران مقاطعه‌کار که در طی مناقصه‌های دولتی و غیردولتی، اقدام به قرارداد با نیروهای خود می‌نمایند؛ بایستی نسبت به بیمه این نیروها اقدام نمایند. بالطبع؛ پیمانکار مقاطعه‌کار تا مادامی‌که امور مربوط به بیمه کارکنان قراردادی و تسویه‌حساب با سازمان تأمین اجتماعی را تکمیل ننماید، از باقی‌مانده طلب خود از کارفرما محروم هست. عموماً درصد نگهداشت کارفرما در خصوص پرداختی پیمانکار؛ به میزان ۵ درصد هست ولی در برخی از موارد این درصد بنا بر شرایط کاری، متغیر می‌یابد.

کارفرما ‌‌باید قرارداد‌هایی که یک سال از تاریخ خاتمه یا تعلیق‌ یا فسخ آن‌ها گذشته و پیمانکار از ارائه حساب اجتناب نموده‌ به سازمان مراجعه نموده و ضمن اعلام فهرست مشخصات مقاطعه‌کار و مهندسین مشاور از محل ۵ %کل کار و آخرین قسط نگهداری شده‌، جهت پرداخت حق بیمه کارکنان شاغل در قرارداد را به سازمان پرداخت نمایند.